Las salas del museo son once y hay algunos objetos que se exponen en las galerías exteriores.
- Sala de la Época Prehispánica.
Carteles de los primeros sonorenses, tradiciones, su flora, alimentos tradicionales, sus misiones y sus primeros pobladores.
- Los jesuitas.
En 1644 el misionero jesuitas Francisco Paris funda la misión. Carteles sobre la llegada de los jesuitas al río Sonora.
- Sala del Siglo XVIII.
Carteles y fotografías de personajes de esta época, motor de reloj que estaba en la Casa Correccional.
-Sala de los Maderistas.
Fotos y objetos de la época, equipo médico del Dr. Raúl Terán Mirazo.
- Sala de la Familia Téllez Araiza.